Điểm nổi bật nhất trên X-Pro 3 có lẽ chính là thiết kế khác biệt của màn hình điện tử, đem đến cảm giác như đang dùng một chiếc máy ảnh "film" để chụp ảnh vậy. Bên cạnh đó, Fuji X-Pro3 sử dụng cảm biến illuminated 26.1MP X-Trans CMOS 4 và chip xử lý hình ảnh X-Processor 4, sẽ cho chất lượng hình ảnh, tốc độ lấy nét và hiệu năng hoạt động tốt hơn thế hệ trước khá nhiều.
X-Pro3 sử dụng thuật toán cải tiến mới, có khả năng lấy nét tự động ở nơi thiếu sáng đến -6EV, gần như ở mức tối nhất hiện nay. Chức năng chụp HDR mới với khả năng chụp rất nhiều ảnh liên tiếp ở các mức độ phơi sáng khác nhau để mở rộng dải nhạy sáng, giúp ảnh mượt mà với tông màu tự nhiên hơn.
Vỏ ngoài thân máy được làm bằng titanium, giúp tăng độ bền cho máy và khả năng chống ăn mòn theo thời gian. Ngoài ra còn có thêm một lớp phủ chất lượng bên ngoài, mang lại vẻ ngoài bóng bẩy, thanh lịch. Bên trong, khung máy được làm từ hợp kim magie. Khả năng chống chọi thời tiết, chống bụi và ẩm của X-Pro3 là khá tốt. Chiếc máy này cũng có thể chịu trời lạnh với nhiệt độ xuống tới -10 độ C.
Người dùng có thể chuyển đổi dễ dàng giữa ống ngắm quang học (OVF) và ống ngắm điện tử (EVF) tuỳ để phù hợp hơn cho từng mục đích sử dụng khác nhau. Kính ngắm EVF trên X-Pro 3 có 3.69 triệu điểm ảnh, với độ bao phủ 97% không gian màu sRGB, hiệu suất hiển thị nâng cao với tỉ lệ tương phản cao - trên 1:5000 và độ luminance tối đa là 1500cd/m2 để hiển thị chi tiết tốt nhất ngay cả trong vùng rất tối hay quá sáng.
Chức năng mới "Electronic Range Finder" được tích hợp, nó sẽ hiển thị như là một khung EVF thu nhỏ lồng vào OVF để anh em kiểm tra và các cài đặt thông số chụp ảnh. Giúp cho khung ngắm OVF hữu dụng hơn.
Màn hình cảm ứng LCD có độ phân giải 1.62 MP, có thể nghiêng lật 180 độ, cho phép chụp từ phía hông, ở tầm mặt đất hoặc khi giơ máy lên trên đầu. Màn hình cung cấp góc nhìn rộng và đem tới độ tương phản cao cùng khả năng tái tạo màu sắc tự nhiên, mang tới cái nhìn trực quan nhất khi anh em chụp ảnh bằng màn hình LCD này.
Màn hình phụ "Memory LCD" 1.28 inch, được bảo vệ bằng kính cường lực, hiển thị các thông số được cài đặt để chụp ảnh, bất kể khi máy có được bật hay không. Màn hình phụ này có thể được đặt ở chế độ "Classic", hiển thị các chế độ giả lập film, cân bằng trắng và các cài đặt khác gợi liên tưởng tới máy ảnh chụp film mạnh mẽ hơn, hoặc chế độ "Standard" hiển thị tốc độ màn trập, ISO và các chế độ chụp khác hiển thị bằng số hay biểu tượng đơn giản.
Chức năng điều chỉnh Black & White, được giới thiệu ở X-T3 và X-T30 cho ra tông màu ấm và lạnh cho ảnh đơn sắc, đã được cập nhật thành chức năng "Monochromatic Colour". X-Pro3 cho phép bạn chọn những màu chủ đạo từ bảng màu kết hợp giữa Warm / Cool và Magenta / Green, với sự chuyển màu phong phú này sẽ giúp bạn tạo ra những hình ảnh có màu sắc riêng biệt và thú vị hơn.
"Clarity setting" đã được đưa vào để anh em có thể tuỳ chỉnh được chi tiết ở những vùng thiếu sáng, dư sáng hoặc chỉnh được độ nét của vật thể. Chi tiết và đường viền của chủ thể có thể được làm nổi bật mạnh lên hoặc làm mềm đi trong khi vẫn giữ độ chuyển màu của tổng thể bức ảnh.
Chức năng Grain Effect giả lập màu film đã được phát triển thêm, vì thế anh em có thể điều chỉnh được mật độ và kích cỡ hạt để đạt được sự kiểm soát chính xác hơn với độ nhiễu hạt, thay vì chỉ có hai chức năng là "strong" và "weak" như các phiên bản trước.
Các chức năng của menu nhanh "Q" cũng được cải tiến. Bạn có thể chọn số lượng biểu tượng hiển thị trong menu từ 16, 12, 8, hoặc 4. "Transparent" là một tuỳ chọn khác để sử dụng dưới nền, cho phép bạn thay đổi các cài đặt nhưng vẫn đảm bảo bạn sẽ không bỏ lỡ những khoảnh khắc chụp ảnh.
X-Pro3 sử dụng cổng USB-C (USB3.1 Gen1) to sạc pin và truyền dữ liệu. Kích thước máy: 140.5 x 82.8 x 46.1mm với khối lượng: 497g.